V rámci aktivit pro veřejnost uskutečňuje Centrum celoživotního vzdělávání program Juniorská univerzita Karlova. V akademickém roce 2023/2024 se uskuteční již devátý ročník!

Program je určen  pro studenty středních škol (v případě víceletých gymnázií pro vyšší stupeň) a je uskutečňován formou přednášek jednotlivých zapojených fakult a dalších součástí univerzity. Témata přednášek jsou průřezová podle zaměření příslušných pracovišť a jsou přizpůsobená věku studentů středních škol.

Program je realizován ve čtyřech zaměřeních, tj. lékařském, společenskovědním, přírodovědném a humanitním s kapacitou pro 150 účastníků v každém zaměření.